《魔兽》（2016）
《魔兽》是一部奇幻动作片，由邓肯·琼斯执导，崔维斯·费米尔、托比·凯贝尔、宝拉·巴顿、本·施耐泽、本·福斯特、吴彦祖、多米尼克·库珀、罗伯特·卡辛斯基联合主演 。影片根据1994年暴雪娱乐制作的游戏《魔兽争霸：人类与兽人》改编，以人类联盟和兽人部落之间发生冲突为背景，讲述了黑暗之门打开之后，两个世界的种族为了各自的生存和家园奋起而战的故事。
吴彦祖在片中饰演古尔丹一角，由于片中兽人特效全靠动作以及面部表情捕捉，所以实际拍摄起来难度并不低，而且看起来还很无聊。吴彦祖透露，他饰演古尔丹的时候，大多数时间都是半蹲着，对体力十分考验，绝对是自己演过最耗体力的角色。
《滚蛋吧！肿瘤君》（2015）
《滚蛋吧！肿瘤君》由韩延执导，白百何和吴彦祖主演。该影片讲述了29岁的乐天派漫画家熊顿因患癌症身处人生最艰难的时刻但同样对着命运微笑的故事。
《滚蛋吧！肿瘤君》把我弄哭了，并且不止一次。但这不是一部虐心的电影，熊顿踏上毫无悬念的旅程，死亡是终点，而留给观众的，却是生的希望，用熊顿的微笑赶走这个世界的阴霾，真正给予你力量，让你勇敢面对未知又坎坷的人生路。
《窃听风云2》（2011）
《窃听风云2》由麦兆辉、庄文强执导兼编剧，尔冬升监制，古天乐、刘青云、吴彦祖领衔主演。该片讲述了因一场车祸而引发的窃听事件，最终警察查出了一个名为“地主会”的神秘组织。
对于国内影片较少涉及的商业犯罪，麦庄两人把握得不错，复杂的情节表述，配合尔冬升标志性的干练灰黄镜头，在给足神秘感的情境下，挑战观众智商。“地主会”里几个港片老戏骨们的压场，让电影显得厚重许多。影片的情节结构有些类似好莱坞式复仇电影，但其中又包含着“我的命，我自己操盘”的香港情结与叙事格调，镜头切换快速精准，有那么点向老香港电影致敬的意思。
《窃听风云》（2009）
《窃听风云》由麦兆辉、庄文强执导，古天乐、刘青云、吴彦祖、张静初等人主演。该片讲述了三名警察在利益诱惑下进行窃听交易并销毁证据，但最终难逃杀戮的悲情故事。
《窃听风云》继承了《无间道》系列的剧本优势，没有为了迎合内地上映标准而放弃本港特色，反而结合得非常出色。《窃听风云》拍出了港片兴盛时期的精气神，整体的感觉是一部很有血性的电影，一部很硬朗的男人戏，结局部分的快意恩仇也都一气呵成。
《门徒》（2007）
《门徒》是由尔冬升执导的剧情片，刘德华、古天乐、吴彦祖、张静初、袁咏仪领衔主演。影片讲述一个关于毒品的故事，他的目的在于告诉人们远离毒品珍惜生活，片中的每一个角色几乎都是毒品的受害者，但他们每个人都要为自己的结果承担责任。
《门徒》由尔冬升（执导）、陈可辛（监制）、黄建新（剧本顾问）三位大导演监工，水准着实不俗，不仅动人心魄戏味十足，而且注重实感，极具醒世意义，堪称近年港片难得的佳作。
《旺角黑夜》（2004）
《旺角黑夜》是由尔冬升执导，张柏芝、吴彦祖、方中信等演员主演的动作剧情片。影片讲述了一个到香港打工的北方姑娘和一个枪手在24小时内发生的故事。
《旺角黑夜》在题材上非常新颖，在叙事上也相当流畅，擅长文艺片的导演尔冬升给了观众一个惊喜。处理细节一向是尔冬升的拿手好戏。片中新手误杀房客一场戏拍得相当精彩，刹那间由剧烈响声转换为沉静，极具张力，突出了强烈的突然性和震撼感，画面和音效更是韵味十足。再如来福被射杀一段同样也出色，可谓意味深长。尔冬升是将警匪片当做文戏来处理，很顺利的驾驭着情节自由翱翔，全片由头到尾也仅开过数枪，倒是赶上了剧情至上的潮流。
《新扎师妹》（2002）
《新扎师妹》是一部爱情喜剧电影，由马伟豪执导，杨千嬅、吴彦祖领衔，黄浩然、许绍雄、查小欣等出演。为“新扎师妹系列”开端。该片讲述一个傻大姐型的警校毕业生方丽娟（杨千嬅饰）糊里糊涂与黑帮大少区海文（吴彦祖饰）之间发生爱情的搞笑故事。
《新扎师妹》的故事虽然简单，却被导演演绎得生动有趣、一波三折，从杨千嬅本来想急于完成任务到对吴彦祖情愫暗生，再到警方开始顺水推舟后来怕弄假成真令杨千嬅中途退出，又到两人冲破险阻到了一起之后，吴彦祖却真的要为义父报仇要暗杀老大等等情节都能让人一看上便不能罢手，直欲探个究竟。
《游园惊梦》（2001）
《游园惊梦》是由杨凡执导，由宫泽理惠、王祖贤、吴彦祖共同主演的爱情电影。讲述了嫁入荣府的歌妓翠花与家族表亲荣兰之间的情感故事。
该片与杨凡导演的另一部作品《美少年之恋》相比，同样有林青霞的旁白，同样涉及同性恋题材，同样是一个爱与欲交织缠绵的故事，只是唯美感却更为淋漓尽致。宫泽理惠演绎昆曲的段子时，神情、动作、身段熟练自然。一颦一笑中，所有魅力都在眼波里流转，极具吸引力。男性的坚强和女性的温柔、华丽和颓废被王祖贤融合得自然而传神。而片中服装、道具、场景非常精致秀美，尤其是家具、字画的摆设等细微处更是尽善尽美。
《美少年之恋》（1998）
《美少年之恋》是由杨凡执导，张艾嘉监制，冯德伦、吴彦祖、舒淇领衔主演的同性题材电影。该片讲述了两个男生Sam与Jet之间的爱情故事。Jet在偶遇Sam后被他的气质所吸引而一直无法忘怀，后主动与Sam交往并坠入了爱河。
该片画面营造出来的气氛非常唯美。剧本与导演技法是杨凡历年来的作品中最好的。故事非常完整，浪漫感人。情节的交错编排很妙，角色也塑造得相当成功，摄影尽善尽美，焦距的灵活使用尤其精彩。
《玻璃之城》（1998）
《玻璃之城》是由张婉婷执导，黎明、舒淇、吴彦祖、陈奕迅主演的爱情电影。影片讲述了一对被迫分手的恋人，在各自婚嫁后意外重逢，在往事与旧情挥之不去下重续前缘的凄美爱情故事。
虽然《玻璃之城》所呈现的这段婚外之恋，用世俗的眼光来看无疑是三观难正的，但那种明明刻骨铭心却又犹如玻璃般脆弱的爱情，在黎明与舒淇尤为精湛的演技下，在那“我的生命线，事业线，爱情线，都是用你的名字拼成的。”的誓言中,却又变得如此真挚，而失之交臂与已然不可企及的痛苦，使那一场本自悲剧的车祸却俨然为这段纯美却又难成眷属的爱情画上了一个最好的结局。